Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.288860Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 181 / 3259021 12 / 403641 474 / 25718729 7 / 491920 181 / 3259021 12 / 403641 474 / 25718729 7 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 52 / 261599   194 / 7554651 -- 52 / 261599 0 / 2128 194 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 9 / 56549 -- 10 / 233710 1 / 43127 9 / 56549 -- 10 / 233710 1 / 43127
cerebrum 8 / 228104 -- -- -- 8 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 26 / 718928 1 / 9837 68 / 2760977 -- 26 / 718928 1 / 9837 68 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 13 / 94929 -- 3 / 138066 -- 13 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 7 / 548222 -- 0 / 34979 -- 7 / 548222 --
heart   -- 8 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 8 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   21 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 21 / 1415985 --
limb   -- 14 / 595880 -- 0 / 16187 -- 14 / 595880 --
liver 1 / 104633   10 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 10 / 527425 --
lung 2 / 26861 1 / 72516 18 / 943009 -- 2 / 26861 1 / 72516 18 / 943009 --
lymph node   -- 6 / 344354 -- 0 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 10 / 216846 4 / 960632 1 / 178606 3 / 85464 10 / 216846 4 / 960632 1 / 178606
muscle 5 / 24130 -- 1 / 137075 -- 5 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 6 / 354066 -- 2 / 43149 -- 6 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   11 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 11 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 6 / 292212 -- 2 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   3 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 10 / 636203 -- 3 / 82470 -- 10 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   9 / 615945 2 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 9 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   6 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 5 / 218318 -- 0 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   6 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus 6 / 100203   3 / 346181 -- 6 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 11 / 262740     -- 11 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 31 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 31 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 3 / 212613 -- -- 2 / 531904 3 / 212613