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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.288630Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 751 / 3259021 109 / 403641 4084 / 25718729 36 / 491920 751 / 3259021 109 / 403641 4084 / 25718729 36 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 10 / 38915 -- 3 / 64924 -- 10 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 49 / 100926 -- 5 / 103390 -- 49 / 100926 -- 5 / 103390 --
brain 91 / 261599 4 / 2128 2868 / 7554651 -- 91 / 261599 4 / 2128 2868 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 15 / 56549 -- 45 / 233710 6 / 43127 15 / 56549 -- 45 / 233710 6 / 43127
cerebrum 77 / 228104 -- -- -- 77 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 16 / 51804   -- -- 16 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 105 / 718928 6 / 9837 197 / 2760977 -- 105 / 718928 6 / 9837 197 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 46 / 211918 -- -- -- 46 / 211918 --
eye 13 / 94929 -- 14 / 138066 -- 13 / 94929 -- 14 / 138066 --
gastrointestinal tract 6 / 34979 -- 73 / 548222 -- 6 / 34979 -- 73 / 548222 --
heart 27 / 49793 -- 60 / 1231698 -- 27 / 49793 -- 60 / 1231698 --
kidney 29 / 121184   70 / 1415985 -- 29 / 121184 0 / 2215 70 / 1415985 --
limb   -- 83 / 595880 -- 0 / 16187 -- 83 / 595880 --
liver 4 / 104633 1 / 6685 14 / 527425 -- 4 / 104633 1 / 6685 14 / 527425 --
lung 3 / 26861 23 / 72516 53 / 943009 -- 3 / 26861 23 / 72516 53 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 12 / 344354 -- 2 / 14648 -- 12 / 344354 --
lymphoreticular   8 / 5421 -- -- 0 / 3137 8 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 36 / 216846 32 / 960632 5 / 178606 6 / 85464 36 / 216846 32 / 960632 5 / 178606
muscle 8 / 24130 -- 7 / 137075 -- 8 / 24130 -- 7 / 137075 --
nervous 9 / 35780 -- -- -- 9 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 15 / 354066 -- 1 / 43149 -- 15 / 354066 --
pancreas 18 / 75220   93 / 1338446 -- 18 / 75220 0 / 34 93 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 10 / 9981 -- -- -- 10 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 5 / 145854 -- 0 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta 5 / 37653 -- 18 / 292212 -- 5 / 37653 -- 18 / 292212 --
pooled tissue 29 / 99675 -- -- -- 29 / 99675 -- -- --
prostate     23 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 23 / 386047 --
retina 20 / 82470 -- 43 / 636203 -- 20 / 82470 -- 43 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 12 / 85891 3 / 31511 24 / 615945 1 / 57574 12 / 85891 3 / 31511 24 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 2 / 17831 19 / 386635 -- 2 / 73492 2 / 17831 19 / 386635 --
stem cell -- -- 20 / 234473 -- -- -- 20 / 234473 --
stomach 13 / 21241 -- 14 / 218318 -- 13 / 21241 -- 14 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 99 / 116987   26 / 736319 -- 99 / 116987 0 / 2634 26 / 736319 --
thymus 10 / 100203 20 / 20273 21 / 346181 -- 10 / 100203 20 / 20273 21 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 53 / 262740 6 / 14058 9 / 25954 -- 53 / 262740 6 / 14058 9 / 25954 --
uterus 3 / 6854 -- 7 / 206823 -- 3 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular   -- 100 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 100 / 1092595 --
white blood cells -- -- 16 / 398838 -- -- -- 16 / 398838 --
whole body -- -- 49 / 531904 24 / 212613 -- -- 49 / 531904 24 / 212613