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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28840Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 94 / 3259021 15 / 403641 396 / 25718729 11 / 491920 94 / 3259021 15 / 403641 396 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 1 / 103390 -- 2 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 1 / 261599   21 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 21 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 1 / 233710 1 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   79 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 79 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 3 / 138066 -- 3 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 7 / 548222 -- 0 / 34979 -- 7 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney     23 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 23 / 1415985 --
limb   -- 25 / 595880 -- 0 / 16187 -- 25 / 595880 --
liver   1 / 6685 3 / 527425 -- 0 / 104633 1 / 6685 3 / 527425 --
lung   5 / 72516 19 / 943009 -- 0 / 26861 5 / 72516 19 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 9 / 344354 -- 2 / 14648 -- 9 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 7 / 216846 18 / 960632 1 / 178606 1 / 85464 7 / 216846 18 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 11 / 354066 -- 3 / 43149 -- 11 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   9 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 6 / 292212 -- 1 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     7 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 7 / 386047 --
retina   -- 8 / 636203 -- 0 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin   2 / 31511 17 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 2 / 31511 17 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   15 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 15 / 386635 --
stem cell -- -- 15 / 234473 -- -- -- 15 / 234473 --
stomach   -- 7 / 218318 -- 0 / 21241 -- 7 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   31 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 31 / 736319 --
thymus 7 / 100203   16 / 346181 -- 7 / 100203 0 / 20273 16 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 14 / 262740   1 / 25954 -- 14 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 9 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 9 / 1092595 --
white blood cells -- -- 12 / 398838 -- -- -- 12 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 8 / 212613 -- -- 4 / 531904 8 / 212613