Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28721Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 461 / 3259021 41 / 403641 1349 / 25718729 9 / 491920 461 / 3259021 41 / 403641 1349 / 25718729 9 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 6 / 64924 -- 2 / 38915 -- 6 / 64924 --
bone marrow 13 / 100926 -- 1 / 103390 -- 13 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 41 / 261599   425 / 7554651 -- 41 / 261599 0 / 2128 425 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 -- 19 / 233710   6 / 56549 -- 19 / 233710 0 / 43127
cerebrum 17 / 228104 -- -- -- 17 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 151 / 718928 3 / 9837 220 / 2760977 -- 151 / 718928 3 / 9837 220 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 13 / 211918 -- -- -- 13 / 211918 --
eye 9 / 94929 -- 7 / 138066 -- 9 / 94929 -- 7 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 33 / 548222 -- 0 / 34979 -- 33 / 548222 --
heart 7 / 49793 -- 68 / 1231698 -- 7 / 49793 -- 68 / 1231698 --
kidney 15 / 121184   45 / 1415985 -- 15 / 121184 0 / 2215 45 / 1415985 --
limb   -- 53 / 595880 -- 0 / 16187 -- 53 / 595880 --
liver 2 / 104633   11 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 11 / 527425 --
lung 9 / 26861 13 / 72516 66 / 943009 -- 9 / 26861 13 / 72516 66 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 17 / 344354 -- 2 / 14648 -- 17 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 22 / 216846 21 / 960632 3 / 178606 5 / 85464 22 / 216846 21 / 960632 3 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 15 / 137075 -- 2 / 24130 -- 15 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 17 / 354066 -- 1 / 43149 -- 17 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   61 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 61 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 3 / 145854 -- 3 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 6 / 37653 -- 3 / 292212 -- 6 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 21 / 99675 -- -- -- 21 / 99675 -- -- --
prostate     10 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 10 / 386047 --
retina 15 / 82470 -- 34 / 636203 -- 15 / 82470 -- 34 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 3 / 31511 27 / 615945 2 / 57574 6 / 85891 3 / 31511 27 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     28 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 28 / 386635 --
stem cell -- -- 14 / 234473 -- -- -- 14 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 24 / 218318 -- 2 / 21241 -- 24 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 34 / 116987   29 / 736319 -- 34 / 116987 0 / 2634 29 / 736319 --
thymus 24 / 100203   23 / 346181 -- 24 / 100203 0 / 20273 23 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 47 / 262740     -- 47 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 13 / 206823 -- 0 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 33 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 33 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 6 / 531904 4 / 212613 -- -- 6 / 531904 4 / 212613