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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.285453Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 260 / 3259021 42 / 403641 1055 / 25718729 21 / 491920 260 / 3259021 42 / 403641 1055 / 25718729 21 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 9 / 38915 -- 1 / 64924 -- 9 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 1 / 103390 -- 2 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 61 / 261599   315 / 7554651 -- 61 / 261599 0 / 2128 315 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 9 / 233710   2 / 56549 -- 9 / 233710 0 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804 1 / 689 -- -- 4 / 51804 1 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 63 / 718928 2 / 9837 202 / 2760977 -- 63 / 718928 2 / 9837 202 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 10 / 211918 -- -- -- 10 / 211918 --
eye 19 / 94929 -- 16 / 138066 -- 19 / 94929 -- 16 / 138066 --
gastrointestinal tract 7 / 34979 -- 38 / 548222 -- 7 / 34979 -- 38 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 51 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 51 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   37 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 37 / 1415985 --
limb   -- 41 / 595880 -- 0 / 16187 -- 41 / 595880 --
liver     12 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 12 / 527425 --
lung   10 / 72516 38 / 943009 -- 0 / 26861 10 / 72516 38 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 8 / 344354 -- 1 / 14648 -- 8 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   26 / 216846 14 / 960632 3 / 178606 0 / 85464 26 / 216846 14 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 4 / 137075 -- 0 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 5 / 354066 -- 3 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   40 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 40 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 2 / 145854 -- 1 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 8 / 292212 -- 1 / 37653 -- 8 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate     8 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 8 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 34 / 636203 -- 8 / 82470 -- 34 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 3 / 31511 20 / 615945 4 / 57574 3 / 85891 3 / 31511 20 / 615945 4 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   10 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 10 / 386635 --
stem cell -- -- 10 / 234473 -- -- -- 10 / 234473 --
stomach   -- 10 / 218318 -- 0 / 21241 -- 10 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   19 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 19 / 736319 --
thymus 3 / 100203   14 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 14 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 29 / 262740     -- 29 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 2 / 206823 -- 1 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 50 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 50 / 1092595 --
white blood cells -- -- 12 / 398838 -- -- -- 12 / 398838 --
whole body -- -- 14 / 531904 14 / 212613 -- -- 14 / 531904 14 / 212613