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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.284649Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 317 / 3259021 30 / 403641 197 / 25718729 3 / 491920 317 / 3259021 30 / 403641 197 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 8 / 38915 --   -- 8 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 26 / 261599   46 / 7554651 -- 26 / 261599 0 / 2128 46 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 12 / 56549 -- 4 / 233710   12 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 12 / 228104 -- -- -- 12 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 13 / 39315 -- -- -- 13 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 74 / 718928   23 / 2760977 -- 74 / 718928 0 / 9837 23 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 11 / 94929 -- 3 / 138066 -- 11 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 4 / 548222 -- 0 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart   -- 11 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   7 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 7 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 7 / 595880 -- 1 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 3 / 104633   3 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 14 / 26861 6 / 72516 30 / 943009 -- 14 / 26861 6 / 72516 30 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 22 / 216846 3 / 960632   8 / 85464 22 / 216846 3 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 14 / 43149 -- 1 / 354066 -- 14 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 7 / 75220   9 / 1338446 -- 7 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 4 / 9981 -- -- -- 4 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 1 / 145854 -- 3 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 19 / 82470 -- 4 / 636203 -- 19 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891   1 / 615945 2 / 57574 5 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 21 / 73492   1 / 386635 -- 21 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   2 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 3 / 100203     -- 3 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 34 / 262740 2 / 14058 1 / 25954 -- 34 / 262740 2 / 14058 1 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 20 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 20 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 8 / 531904 1 / 212613 -- -- 8 / 531904 1 / 212613