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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28379Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 462 / 3259021 49 / 403641 1016 / 25718729 11 / 491920 462 / 3259021 49 / 403641 1016 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 -- 8 / 64924 -- 5 / 38915 -- 8 / 64924 --
bone marrow 19 / 100926 -- 2 / 103390 -- 19 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 40 / 261599   170 / 7554651 -- 40 / 261599 0 / 2128 170 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 7 / 56549 -- 18 / 233710 1 / 43127 7 / 56549 -- 18 / 233710 1 / 43127
cerebrum 20 / 228104 -- -- -- 20 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804 1 / 689 -- -- 2 / 51804 1 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 125 / 718928   207 / 2760977 -- 125 / 718928 0 / 9837 207 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 35 / 94929 -- 13 / 138066 -- 35 / 94929 -- 13 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 46 / 548222 -- 1 / 34979 -- 46 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 57 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 57 / 1231698 --
kidney 12 / 121184 2 / 2215 61 / 1415985 -- 12 / 121184 2 / 2215 61 / 1415985 --
limb 6 / 16187 -- 21 / 595880 -- 6 / 16187 -- 21 / 595880 --
liver 9 / 104633   21 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 21 / 527425 --
lung 1 / 26861 11 / 72516 56 / 943009 -- 1 / 26861 11 / 72516 56 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 15 / 344354 -- 2 / 14648 -- 15 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 24 / 216846 25 / 960632 3 / 178606 12 / 85464 24 / 216846 25 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 7 / 43149 -- 11 / 354066 -- 7 / 43149 -- 11 / 354066 --
pancreas 10 / 75220   39 / 1338446 -- 10 / 75220 0 / 34 39 / 1338446 --
pancreatic islet 5 / 30771 -- -- -- 5 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 5 / 17986 -- 6 / 145854 -- 5 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta 4 / 37653 -- 16 / 292212 -- 4 / 37653 -- 16 / 292212 --
pooled tissue 22 / 99675 -- -- -- 22 / 99675 -- -- --
prostate     9 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 9 / 386047 --
retina 10 / 82470 -- 36 / 636203 -- 10 / 82470 -- 36 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 20 / 85891 7 / 31511 28 / 615945 2 / 57574 20 / 85891 7 / 31511 28 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 6 / 73492   22 / 386635 -- 6 / 73492 0 / 17831 22 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 13 / 218318 -- 2 / 21241 -- 13 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 14 / 116987   16 / 736319 -- 14 / 116987 0 / 2634 16 / 736319 --
thymus 21 / 100203   29 / 346181 -- 21 / 100203 0 / 20273 29 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 30 / 262740 3 / 14058   -- 30 / 262740 3 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 4 / 206823 -- 2 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 23 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 23 / 1092595 --
white blood cells -- -- 16 / 398838 -- -- -- 16 / 398838 --
whole body -- -- 17 / 531904 5 / 212613 -- -- 17 / 531904 5 / 212613