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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28300Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 303 / 3259021 44 / 403641 885 / 25718729 23 / 491920 303 / 3259021 44 / 403641 885 / 25718729 23 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 1 / 103390 -- 3 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 32 / 261599   230 / 7554651 -- 32 / 261599 0 / 2128 230 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 14 / 233710 1 / 43127 8 / 56549 -- 14 / 233710 1 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 100 / 718928 1 / 9837 105 / 2760977 -- 100 / 718928 1 / 9837 105 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 11 / 94929 -- 8 / 138066 -- 11 / 94929 -- 8 / 138066 --
gastrointestinal tract 8 / 34979 -- 31 / 548222 -- 8 / 34979 -- 31 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 44 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 44 / 1231698 --
kidney 9 / 121184   33 / 1415985 -- 9 / 121184 0 / 2215 33 / 1415985 --
limb   -- 20 / 595880 -- 0 / 16187 -- 20 / 595880 --
liver 2 / 104633   10 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 10 / 527425 --
lung 6 / 26861 7 / 72516 83 / 943009 -- 6 / 26861 7 / 72516 83 / 943009 --
lymph node   -- 8 / 344354 -- 0 / 14648 -- 8 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 34 / 216846 27 / 960632 8 / 178606 8 / 85464 34 / 216846 27 / 960632 8 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 7 / 137075 -- 2 / 24130 -- 7 / 137075 --
nervous 9 / 35780 -- -- -- 9 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 9 / 354066 -- 3 / 43149 -- 9 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   22 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 22 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 6 / 145854 -- 0 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 7 / 292212 -- 1 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate 6 / 23701   13 / 386047 -- 6 / 23701 0 / 5 13 / 386047 --
retina 9 / 82470 -- 36 / 636203 -- 9 / 82470 -- 36 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 8 / 85891 1 / 31511 48 / 615945   8 / 85891 1 / 31511 48 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     13 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 13 / 386635 --
stem cell -- -- 7 / 234473 -- -- -- 7 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 12 / 218318 -- 4 / 21241 -- 12 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   15 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 15 / 736319 --
thymus 13 / 100203   11 / 346181 -- 13 / 100203 0 / 20273 11 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 -- 15 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 16 / 206823 -- 1 / 6854 -- 16 / 206823 --
vascular   -- 23 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 23 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 15 / 531904 14 / 212613 -- -- 15 / 531904 14 / 212613