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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.282800Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 88 / 3259021   642 / 25718729 1 / 491920 88 / 3259021 0 / 403641 642 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 7 / 261599   192 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 192 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 17 / 718928   82 / 2760977 -- 17 / 718928 0 / 9837 82 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 11 / 211918 -- -- -- 11 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 7 / 34979 -- 6 / 548222 -- 7 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart   -- 9 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 9 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   8 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 1 / 104633   3 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 5 / 344354 -- 0 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 19 / 85464   200 / 960632 1 / 178606 19 / 85464 0 / 216846 200 / 960632 1 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 1 / 137075 -- 2 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 8 / 35780 -- -- -- 8 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     32 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 32 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   10 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 10 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 24 / 636203 -- 6 / 82470 -- 24 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     6 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 6 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus     2 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 4 / 262740     -- 4 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 --   -- 1 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 30 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 30 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904   -- -- 7 / 531904 0 / 212613