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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28237Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 303 / 3259021 70 / 403641 1089 / 25718729 18 / 491920 303 / 3259021 70 / 403641 1089 / 25718729 18 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 1 / 64924 -- 3 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 2 / 103390 -- 5 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 30 / 261599 1 / 2128 395 / 7554651 -- 30 / 261599 1 / 2128 395 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 9 / 233710 3 / 43127 4 / 56549 -- 9 / 233710 3 / 43127
cerebrum 35 / 228104 -- -- -- 35 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 73 / 718928 1 / 9837 106 / 2760977 -- 73 / 718928 1 / 9837 106 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 6 / 94929 -- 4 / 138066 -- 6 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 21 / 548222 -- 1 / 34979 -- 21 / 548222 --
heart 6 / 49793 -- 45 / 1231698 -- 6 / 49793 -- 45 / 1231698 --
kidney 9 / 121184   42 / 1415985 -- 9 / 121184 0 / 2215 42 / 1415985 --
limb   -- 14 / 595880 -- 0 / 16187 -- 14 / 595880 --
liver 2 / 104633   10 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 10 / 527425 --
lung 4 / 26861 9 / 72516 56 / 943009 -- 4 / 26861 9 / 72516 56 / 943009 --
lymph node   -- 8 / 344354 -- 0 / 14648 -- 8 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137   -- -- 1 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 37 / 216846 35 / 960632 14 / 178606 7 / 85464 37 / 216846 35 / 960632 14 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 7 / 137075 -- 1 / 24130 -- 7 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 22 / 354066 -- 2 / 43149 -- 22 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   35 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 35 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 9 / 145854 -- 3 / 17986 -- 9 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 4 / 292212 -- 2 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   29 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 29 / 386047 --
retina 7 / 82470 -- 26 / 636203 -- 7 / 82470 -- 26 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 12 / 85891 9 / 31511 35 / 615945   12 / 85891 9 / 31511 35 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 8 / 17831 9 / 386635 -- 4 / 73492 8 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 14 / 218318 -- 1 / 21241 -- 14 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987 1 / 2634 42 / 736319 -- 4 / 116987 1 / 2634 42 / 736319 --
thymus 3 / 100203   8 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 8 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 48 / 262740 4 / 14058   -- 48 / 262740 4 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 8 / 206823 -- 1 / 6854 -- 8 / 206823 --
vascular   -- 71 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 71 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 12 / 531904 1 / 212613 -- -- 12 / 531904 1 / 212613