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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.281700Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 218 / 3259021 13 / 403641 404 / 25718729   218 / 3259021 13 / 403641 404 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 63 / 261599   326 / 7554651 -- 63 / 261599 0 / 2128 326 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 3 / 233710   5 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 58 / 228104 -- -- -- 58 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 16 / 718928   8 / 2760977 -- 16 / 718928 0 / 9837 8 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 --   -- 3 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 1 / 49793 --   -- 1 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   2 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node 4 / 14648 --   -- 4 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 13 / 216846 6 / 960632   3 / 85464 13 / 216846 6 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   30 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 30 / 1338446 --
pancreatic islet 8 / 30771 -- -- -- 8 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 6 / 9981 -- -- -- 6 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 3 / 145854 -- 1 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 10 / 82470 -- 7 / 636203 -- 10 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891       3 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492     -- 1 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987     -- 2 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740     -- 8 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 10 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 10 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613