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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28146Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 202 / 3259021 24 / 403641 1043 / 25718729 25 / 491920 202 / 3259021 24 / 403641 1043 / 25718729 25 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 22 / 100926 -- 4 / 103390 -- 22 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 6 / 261599   259 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 259 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 67 / 233710 2 / 43127 5 / 56549 -- 67 / 233710 2 / 43127
cerebrum 16 / 228104 -- -- -- 16 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804   -- -- 7 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 30 / 718928   141 / 2760977 -- 30 / 718928 0 / 9837 141 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 10 / 211918 -- -- -- 10 / 211918 --
eye 5 / 94929 -- 7 / 138066 -- 5 / 94929 -- 7 / 138066 --
gastrointestinal tract 9 / 34979 -- 42 / 548222 -- 9 / 34979 -- 42 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 58 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 58 / 1231698 --
kidney 6 / 121184   65 / 1415985 -- 6 / 121184 0 / 2215 65 / 1415985 --
limb 10 / 16187 -- 30 / 595880 -- 10 / 16187 -- 30 / 595880 --
liver 3 / 104633   15 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 15 / 527425 --
lung 2 / 26861 9 / 72516 43 / 943009 -- 2 / 26861 9 / 72516 43 / 943009 --
lymph node   -- 6 / 344354 -- 0 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 4 / 216846 20 / 960632 4 / 178606 4 / 85464 4 / 216846 20 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 8 / 137075 -- 0 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary   -- 7 / 354066 -- 0 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 7 / 75220   27 / 1338446 -- 7 / 75220 0 / 34 27 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 10 / 292212 -- 0 / 37653 -- 10 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     8 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 8 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 32 / 636203 -- 5 / 82470 -- 32 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891 11 / 31511 58 / 615945 2 / 57574 9 / 85891 11 / 31511 58 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   8 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 8 / 386635 --
stem cell -- -- 17 / 234473 -- -- -- 17 / 234473 --
stomach   -- 13 / 218318 -- 0 / 21241 -- 13 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   24 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 24 / 736319 --
thymus 5 / 100203   10 / 346181 -- 5 / 100203 0 / 20273 10 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 33 / 262740   2 / 25954 -- 33 / 262740 0 / 14058 2 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 19 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 19 / 1092595 --
white blood cells -- -- 18 / 398838 -- -- -- 18 / 398838 --
whole body -- -- 11 / 531904 17 / 212613 -- -- 11 / 531904 17 / 212613