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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.281287Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 118 / 3259021   150 / 25718729 4 / 491920 118 / 3259021 0 / 403641 150 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   -- 1 / 103390 -- 0 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 35 / 261599   42 / 7554651 -- 35 / 261599 0 / 2128 42 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 15 / 56549 --     15 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 15 / 228104 -- -- -- 15 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 19 / 718928   19 / 2760977 -- 19 / 718928 0 / 9837 19 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 1 / 138066 -- 2 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 4 / 548222 -- 0 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney     12 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 12 / 1415985 --
limb   -- 9 / 595880 -- 0 / 16187 -- 9 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 3 / 26861   13 / 943009 -- 3 / 26861 0 / 72516 13 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland       1 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 1 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 8 / 35780 -- -- -- 8 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     6 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 6 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 --   -- 2 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 11 / 82470 -- 4 / 636203 -- 11 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     1 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   3 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 3 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 6 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 6 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904 3 / 212613 -- -- 1 / 531904 3 / 212613