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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.28058Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 346 / 3259021 35 / 403641 5467 / 25718729 37 / 491920 346 / 3259021 35 / 403641 5467 / 25718729 37 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 6 / 64924 -- 0 / 38915 -- 6 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 15 / 103390 -- 3 / 100926 -- 15 / 103390 --
brain 19 / 261599   2454 / 7554651 -- 19 / 261599 0 / 2128 2454 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 10 / 233710 2 / 43127 4 / 56549 -- 10 / 233710 2 / 43127
cerebrum 25 / 228104 -- -- -- 25 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 76 / 718928   359 / 2760977 -- 76 / 718928 0 / 9837 359 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 64 / 211918 -- -- -- 64 / 211918 --
eye 5 / 94929 -- 23 / 138066 -- 5 / 94929 -- 23 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 127 / 548222 -- 2 / 34979 -- 127 / 548222 --
heart 23 / 49793 -- 293 / 1231698 -- 23 / 49793 -- 293 / 1231698 --
kidney 30 / 121184   329 / 1415985 -- 30 / 121184 0 / 2215 329 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 134 / 595880 -- 1 / 16187 -- 134 / 595880 --
liver 10 / 104633   54 / 527425 -- 10 / 104633 0 / 6685 54 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516 100 / 943009 -- 1 / 26861 3 / 72516 100 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 47 / 344354 -- 1 / 14648 -- 47 / 344354 --
lymphoreticular   2 / 5421 -- -- 0 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 16 / 85464 4 / 216846 107 / 960632 12 / 178606 16 / 85464 4 / 216846 107 / 960632 12 / 178606
muscle 8 / 24130 -- 26 / 137075 -- 8 / 24130 -- 26 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 63 / 354066 -- 3 / 43149 -- 63 / 354066 --
pancreas 15 / 75220   464 / 1338446 -- 15 / 75220 0 / 34 464 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 20 / 145854 -- 0 / 17986 -- 20 / 145854 --
placenta 7 / 37653 -- 36 / 292212 -- 7 / 37653 -- 36 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate 12 / 23701   64 / 386047 -- 12 / 23701 0 / 5 64 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 42 / 636203 -- 4 / 82470 -- 42 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin   3 / 31511 87 / 615945 3 / 57574 0 / 85891 3 / 31511 87 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492 11 / 17831 30 / 386635 -- 3 / 73492 11 / 17831 30 / 386635 --
stem cell -- -- 34 / 234473 -- -- -- 34 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 23 / 218318 -- 2 / 21241 -- 23 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 25 / 116987 4 / 2634 90 / 736319 -- 25 / 116987 4 / 2634 90 / 736319 --
thymus 13 / 100203 7 / 20273 35 / 346181 -- 13 / 100203 7 / 20273 35 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 14 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 -- 14 / 262740 1 / 14058 2 / 25954 --
uterus 3 / 6854 -- 25 / 206823 -- 3 / 6854 -- 25 / 206823 --
vascular   -- 165 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 165 / 1092595 --
white blood cells -- -- 43 / 398838 -- -- -- 43 / 398838 --
whole body -- -- 96 / 531904 20 / 212613 -- -- 96 / 531904 20 / 212613