Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.27990Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 387 / 3259021 49 / 403641 795 / 25718729 19 / 491920 387 / 3259021 49 / 403641 795 / 25718729 19 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 -- 1 / 64924 -- 5 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 15 / 100926 -- 1 / 103390 -- 15 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 39 / 261599   153 / 7554651 -- 39 / 261599 0 / 2128 153 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 21 / 233710   4 / 56549 -- 21 / 233710 0 / 43127
cerebrum 33 / 228104 -- -- -- 33 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 109 / 718928 2 / 9837 122 / 2760977 -- 109 / 718928 2 / 9837 122 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 29 / 94929 -- 6 / 138066 -- 29 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 29 / 548222 -- 1 / 34979 -- 29 / 548222 --
heart 8 / 49793 -- 32 / 1231698 -- 8 / 49793 -- 32 / 1231698 --
kidney 6 / 121184   35 / 1415985 -- 6 / 121184 0 / 2215 35 / 1415985 --
limb 5 / 16187 -- 18 / 595880 -- 5 / 16187 -- 18 / 595880 --
liver 5 / 104633   20 / 527425 -- 5 / 104633 0 / 6685 20 / 527425 --
lung 6 / 26861 11 / 72516 32 / 943009 -- 6 / 26861 11 / 72516 32 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 16 / 344354 -- 1 / 14648 -- 16 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 27 / 216846 38 / 960632 8 / 178606 7 / 85464 27 / 216846 38 / 960632 8 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 5 / 137075 -- 3 / 24130 -- 5 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 7 / 354066 -- 3 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   29 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 29 / 1338446 --
pancreatic islet 6 / 30771 -- -- -- 6 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 5 / 145854 -- 0 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 8 / 292212 -- 2 / 37653 -- 8 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   10 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 10 / 386047 --
retina 14 / 82470 -- 42 / 636203 -- 14 / 82470 -- 42 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 15 / 85891 8 / 31511 38 / 615945 1 / 57574 15 / 85891 8 / 31511 38 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 11 / 73492 1 / 17831 16 / 386635 -- 11 / 73492 1 / 17831 16 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 6 / 218318 -- 0 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987   21 / 736319 -- 7 / 116987 0 / 2634 21 / 736319 --
thymus 15 / 100203   13 / 346181 -- 15 / 100203 0 / 20273 13 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740     -- 16 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 3 / 206823 -- 1 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular 4 / 12366 -- 46 / 1092595 -- 4 / 12366 -- 46 / 1092595 --
white blood cells -- -- 6 / 398838 -- -- -- 6 / 398838 --
whole body -- -- 6 / 531904 10 / 212613 -- -- 6 / 531904 10 / 212613