Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.279782Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 438 / 3259021 23 / 403641 2028 / 25718729 28 / 491920 438 / 3259021 23 / 403641 2028 / 25718729 28 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 -- 11 / 64924 -- 4 / 38915 -- 11 / 64924 --
bone marrow 7 / 100926 -- 58 / 103390 -- 7 / 100926 -- 58 / 103390 --
brain 30 / 261599   943 / 7554651 -- 30 / 261599 0 / 2128 943 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 18 / 233710 4 / 43127 4 / 56549 -- 18 / 233710 4 / 43127
cerebrum 67 / 228104 -- -- -- 67 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 8 / 51804   -- -- 8 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 76 / 718928 1 / 9837 68 / 2760977 -- 76 / 718928 1 / 9837 68 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 6 / 211918 -- -- -- 6 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 1 / 138066 -- 7 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 16 / 34979 -- 11 / 548222 -- 16 / 34979 -- 11 / 548222 --
heart 9 / 49793 -- 40 / 1231698 -- 9 / 49793 -- 40 / 1231698 --
kidney 59 / 121184   328 / 1415985 -- 59 / 121184 0 / 2215 328 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 14 / 595880 -- 2 / 16187 -- 14 / 595880 --
liver 28 / 104633   32 / 527425 -- 28 / 104633 0 / 6685 32 / 527425 --
lung 1 / 26861 7 / 72516 42 / 943009 -- 1 / 26861 7 / 72516 42 / 943009 --
lymph node   -- 19 / 344354 -- 0 / 14648 -- 19 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 15 / 85464 8 / 216846 62 / 960632 9 / 178606 15 / 85464 8 / 216846 62 / 960632 9 / 178606
muscle 8 / 24130 -- 10 / 137075 -- 8 / 24130 -- 10 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 20 / 354066 -- 1 / 43149 -- 20 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   44 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 44 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 9 / 145854 -- 4 / 17986 -- 9 / 145854 --
placenta 11 / 37653 -- 4 / 292212 -- 11 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   23 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 23 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 36 / 636203 -- 4 / 82470 -- 36 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 3 / 31511 71 / 615945 6 / 57574 3 / 85891 3 / 31511 71 / 615945 6 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 2 / 17831 17 / 386635 -- 2 / 73492 2 / 17831 17 / 386635 --
stem cell -- -- 21 / 234473 -- -- -- 21 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 9 / 218318 -- 2 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 5 / 16875 -- -- -- 5 / 16875 -- -- --
testis 10 / 116987   21 / 736319 -- 10 / 116987 0 / 2634 21 / 736319 --
thymus 6 / 100203   10 / 346181 -- 6 / 100203 0 / 20273 10 / 346181 --
thyroid 8 / 8821 -- -- -- 8 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 13 / 262740 1 / 14058   -- 13 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus 6 / 6854 -- 4 / 206823 -- 6 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 19 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 19 / 1092595 --
white blood cells -- -- 31 / 398838 -- -- -- 31 / 398838 --
whole body -- -- 26 / 531904 9 / 212613 -- -- 26 / 531904 9 / 212613