Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.27951Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 137 / 3259021 19 / 403641 346 / 25718729 13 / 491920 137 / 3259021 19 / 403641 346 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 2 / 103390 -- 3 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 5 / 261599   89 / 7554651 -- 5 / 261599 0 / 2128 89 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 5 / 233710 1 / 43127 1 / 56549 -- 5 / 233710 1 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804   -- -- 7 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 39 / 718928 1 / 9837 32 / 2760977 -- 39 / 718928 1 / 9837 32 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 4 / 138066 -- 1 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract 9 / 34979 -- 2 / 548222 -- 9 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 17 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 17 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   20 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 20 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver 7 / 104633   8 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 8 / 527425 --
lung   7 / 72516 15 / 943009 -- 0 / 26861 7 / 72516 15 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 7 / 216846 16 / 960632 10 / 178606 7 / 85464 7 / 216846 16 / 960632 10 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 2 / 137075 -- 1 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 9 / 75220   21 / 1338446 -- 9 / 75220 0 / 34 21 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 4 / 292212 -- 3 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate 5 / 23701   5 / 386047 -- 5 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 14 / 636203 -- 3 / 82470 -- 14 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin   1 / 31511 19 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 1 / 31511 19 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 3 / 17831 9 / 386635 -- 2 / 73492 3 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 4 / 218318 -- 1 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   8 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 8 / 736319 --
thymus 5 / 100203   9 / 346181 -- 5 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 262740     -- 9 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 2 / 206823 -- 1 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 12 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 12 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 11 / 531904 1 / 212613 -- -- 11 / 531904 1 / 212613