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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.277403Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 121 / 3259021 43 / 403641 108 / 25718729 3 / 491920 121 / 3259021 43 / 403641 108 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 10 / 38915 --   -- 10 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 4 / 100926 -- 2 / 103390 -- 4 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 2 / 261599   3 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 3 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 6 / 228104 -- -- -- 6 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804 1 / 689 -- -- 1 / 51804 1 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 5 / 718928 2 / 9837 7 / 2760977 -- 5 / 718928 2 / 9837 7 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 2 / 138066 -- 4 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   3 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 1 / 595880 -- 2 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver 2 / 104633 2 / 6685 1 / 527425 -- 2 / 104633 2 / 6685 1 / 527425 --
lung 2 / 26861 12 / 72516 1 / 943009 -- 2 / 26861 12 / 72516 1 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 2 / 344354 -- 1 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 17 / 85464 21 / 216846 18 / 960632 3 / 178606 17 / 85464 21 / 216846 18 / 960632 3 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 1 / 354066 -- 5 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate     28 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 28 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434 1 / 958 -- -- 1 / 18434 1 / 958 -- --
skin 3 / 85891 2 / 31511 3 / 615945   3 / 85891 2 / 31511 3 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492     -- 3 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 21 / 100203   9 / 346181 -- 21 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 19 / 262740 2 / 14058   -- 19 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 4 / 12366 -- 5 / 1092595 -- 4 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 11 / 398838 -- -- -- 11 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904   -- -- 3 / 531904 0 / 212613