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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.27578Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1128 / 3259021 101 / 403641 10467 / 25718729 99 / 491920 1128 / 3259021 101 / 403641 10467 / 25718729 99 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 20 / 38915 -- 3 / 64924 -- 20 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 29 / 100926 --   -- 29 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 135 / 261599 4 / 2128 3570 / 7554651 -- 135 / 261599 4 / 2128 3570 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 -- 58 / 233710 10 / 43127 6 / 56549 -- 58 / 233710 10 / 43127
cerebrum 75 / 228104 -- -- -- 75 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804 2 / 689 -- -- 7 / 51804 2 / 689 -- --
ear 10 / 39315 -- -- -- 10 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 309 / 718928 5 / 9837 1311 / 2760977 -- 309 / 718928 5 / 9837 1311 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 63 / 211918 -- -- -- 63 / 211918 --
eye 29 / 94929 -- 71 / 138066 -- 29 / 94929 -- 71 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 274 / 548222 -- 2 / 34979 -- 274 / 548222 --
heart 13 / 49793 -- 561 / 1231698 -- 13 / 49793 -- 561 / 1231698 --
kidney 39 / 121184   389 / 1415985 -- 39 / 121184 0 / 2215 389 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 296 / 595880 -- 1 / 16187 -- 296 / 595880 --
liver 22 / 104633   88 / 527425 -- 22 / 104633 0 / 6685 88 / 527425 --
lung 8 / 26861 24 / 72516 539 / 943009 -- 8 / 26861 24 / 72516 539 / 943009 --
lymph node   -- 13 / 344354 -- 0 / 14648 -- 13 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 9 / 85464 56 / 216846 169 / 960632 54 / 178606 9 / 85464 56 / 216846 169 / 960632 54 / 178606
muscle 9 / 24130 -- 122 / 137075 -- 9 / 24130 -- 122 / 137075 --
nervous 19 / 35780 -- -- -- 19 / 35780 -- -- --
ovary 12 / 43149 -- 171 / 354066 -- 12 / 43149 -- 171 / 354066 --
pancreas 10 / 75220   526 / 1338446 -- 10 / 75220 0 / 34 526 / 1338446 --
pancreatic islet 61 / 30771 -- -- -- 61 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 16 / 17986 -- 51 / 145854 -- 16 / 17986 -- 51 / 145854 --
placenta 20 / 37653 -- 386 / 292212 -- 20 / 37653 -- 386 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 6 / 23701   231 / 386047 -- 6 / 23701 0 / 5 231 / 386047 --
retina 43 / 82470 -- 167 / 636203 -- 43 / 82470 -- 167 / 636203 --
salivary gland 5 / 18434   -- -- 5 / 18434 0 / 958 -- --
skin 15 / 85891 2 / 31511 109 / 615945 3 / 57574 15 / 85891 2 / 31511 109 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492 1 / 17831 174 / 386635 -- 5 / 73492 1 / 17831 174 / 386635 --
stem cell -- -- 12 / 234473 -- -- -- 12 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 145 / 218318 -- 4 / 21241 -- 145 / 218318 --
synovium 6 / 16875 -- -- -- 6 / 16875 -- -- --
testis 44 / 116987 1 / 2634 597 / 736319 -- 44 / 116987 1 / 2634 597 / 736319 --
thymus 7 / 100203   100 / 346181 -- 7 / 100203 0 / 20273 100 / 346181 --
thyroid 6 / 8821 -- -- -- 6 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 116 / 262740 6 / 14058   -- 116 / 262740 6 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 108 / 206823 -- 1 / 6854 -- 108 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 87 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 87 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 76 / 531904 32 / 212613 -- -- 76 / 531904 32 / 212613