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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.275608Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 108 / 3259021 23 / 403641 231 / 25718729   108 / 3259021 23 / 403641 231 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 12 / 261599   78 / 7554651 -- 12 / 261599 0 / 2128 78 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 --     2 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 7 / 228104 -- -- -- 7 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 19 / 718928   14 / 2760977 -- 19 / 718928 0 / 9837 14 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 6 / 94929 -- 1 / 138066 -- 6 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 5 / 548222 -- 0 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney     6 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 6 / 1415985 --
limb   -- 4 / 595880 -- 0 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver 4 / 104633 1 / 6685 5 / 527425 -- 4 / 104633 1 / 6685 5 / 527425 --
lung 2 / 26861 2 / 72516 7 / 943009 -- 2 / 26861 2 / 72516 7 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 17 / 216846 4 / 960632   2 / 85464 17 / 216846 4 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 9 / 137075 -- 1 / 24130 -- 9 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 9 / 354066 -- 2 / 43149 -- 9 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   18 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 18 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   4 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 10 / 82470 -- 8 / 636203 -- 10 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 3 / 31511 4 / 615945   1 / 85891 3 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   4 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 1 / 21241 --   -- 1 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   13 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus 1 / 100203     -- 1 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 18 / 262740     -- 18 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 16 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 16 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613