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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.27451Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 204 / 3259021 53 / 403641 102 / 25718729 1 / 491920 204 / 3259021 53 / 403641 102 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 1 / 261599   20 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 20 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 --     4 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 12 / 51804   -- -- 12 / 51804 0 / 689 -- --
ear 10 / 39315 -- -- -- 10 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 38 / 718928   5 / 2760977 -- 38 / 718928 0 / 9837 5 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 8 / 34979 -- 9 / 548222 -- 8 / 34979 -- 9 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney 14 / 121184   6 / 1415985 -- 14 / 121184 0 / 2215 6 / 1415985 --
limb 2 / 16187 --   -- 2 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 9 / 104633 1 / 6685 3 / 527425 -- 9 / 104633 1 / 6685 3 / 527425 --
lung 5 / 26861 10 / 72516 4 / 943009 -- 5 / 26861 10 / 72516 4 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 42 / 216846 13 / 960632   3 / 85464 42 / 216846 13 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   14 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 14 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 2 / 145854 -- 2 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 9 / 37653 -- 1 / 292212 -- 9 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 15 / 99675 -- -- -- 15 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891   5 / 615945 1 / 57574 3 / 85891 0 / 31511 5 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492     -- 2 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid 2 / 8821 -- -- -- 2 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 58 / 262740     -- 58 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 13 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613