Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.27385Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 284 / 3259021 16 / 403641 169 / 25718729 1 / 491920 284 / 3259021 16 / 403641 169 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 11 / 100926 -- 4 / 103390 -- 11 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain     9 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 9 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 4 / 233710   0 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 11 / 39315 -- -- -- 11 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 6 / 718928   13 / 2760977 -- 6 / 718928 0 / 9837 13 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 9 / 548222 -- 0 / 34979 -- 9 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb 3 / 16187 -- 2 / 595880 -- 3 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 9 / 104633   5 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 5 / 527425 --
lung   9 / 72516 7 / 943009 -- 0 / 26861 9 / 72516 7 / 943009 --
lymph node 4 / 14648 -- 11 / 344354 -- 4 / 14648 -- 11 / 344354 --
lymphoreticular   2 / 5421 -- -- 0 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 1 / 216846 9 / 960632 1 / 178606 4 / 85464 1 / 216846 9 / 960632 1 / 178606
muscle 2 / 24130 --   -- 2 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 5 / 354066 -- 2 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   6 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 6 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 107 / 85891   3 / 615945   107 / 85891 0 / 31511 3 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 15 / 73492 4 / 17831 6 / 386635 -- 15 / 73492 4 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 3 / 218318 -- 2 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis     5 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 8 / 100203   3 / 346181 -- 8 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 87 / 262740     -- 87 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 41 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 41 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613