Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.271648Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 105 / 3259021 13 / 403641 503 / 25718729 8 / 491920 105 / 3259021 13 / 403641 503 / 25718729 8 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 31 / 261599   148 / 7554651 -- 31 / 261599 0 / 2128 148 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 5 / 233710   2 / 56549 -- 5 / 233710 0 / 43127
cerebrum 12 / 228104 -- -- -- 12 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804 1 / 689 -- -- 1 / 51804 1 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 7 / 718928 1 / 9837 88 / 2760977 -- 7 / 718928 1 / 9837 88 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 10 / 211918 -- -- -- 10 / 211918 --
eye 5 / 94929 -- 2 / 138066 -- 5 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 16 / 548222 -- 0 / 34979 -- 16 / 548222 --
heart   -- 30 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 30 / 1231698 --
kidney     20 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 20 / 1415985 --
limb   -- 13 / 595880 -- 0 / 16187 -- 13 / 595880 --
liver     2 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung   1 / 72516 20 / 943009 -- 0 / 26861 1 / 72516 20 / 943009 --
lymph node   -- 7 / 344354 -- 0 / 14648 -- 7 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 9 / 216846 8 / 960632 1 / 178606 1 / 85464 9 / 216846 8 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     5 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 3 / 145854 -- 0 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 11 / 292212 -- 1 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate     7 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 7 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 19 / 636203 -- 8 / 82470 -- 19 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   4 / 615945 1 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     2 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   13 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus 1 / 100203   4 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 -- 8 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 48 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 48 / 1092595 --
white blood cells -- -- 6 / 398838 -- -- -- 6 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 6 / 212613 -- -- 2 / 531904 6 / 212613