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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2706Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 35 / 3259021 10 / 403641 1890 / 25718729 1 / 491920 35 / 3259021 10 / 403641 1890 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 8 / 38915 --   -- 8 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 8 / 103390 -- 1 / 100926 -- 8 / 103390 --
brain     19 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 19 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 2 / 233710   0 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804 1 / 689 -- -- 1 / 51804 1 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 3 / 718928   42 / 2760977 -- 3 / 718928 0 / 9837 42 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 20 / 548222 -- 0 / 34979 -- 20 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 7 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney   2 / 2215 1 / 1415985 -- 0 / 121184 2 / 2215 1 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 1 / 26861 4 / 72516 3 / 943009 -- 1 / 26861 4 / 72516 3 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 3 / 216846 30 / 960632   3 / 85464 3 / 216846 30 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     9 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 3 / 292212 -- 2 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina   -- 3 / 636203 -- 0 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     1 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   1 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987     -- 3 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740     -- 6 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 1724 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1724 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 1 / 212613 -- -- 2 / 531904 1 / 212613