Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.268668Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 199 / 3259021 20 / 403641 277 / 25718729 9 / 491920 199 / 3259021 20 / 403641 277 / 25718729 9 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 -- 1 / 64924 -- 4 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 2 / 103390 -- 1 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 3 / 261599   51 / 7554651 -- 3 / 261599 0 / 2128 51 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 12 / 233710   1 / 56549 -- 12 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 122 / 718928   68 / 2760977 -- 122 / 718928 0 / 9837 68 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 9 / 94929 -- 1 / 138066 -- 9 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 7 / 548222 -- 1 / 34979 -- 7 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 25 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 25 / 1231698 --
kidney     10 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 10 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 3 / 104633   3 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 2 / 26861 1 / 72516 6 / 943009 -- 2 / 26861 1 / 72516 6 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 1 / 344354 -- 1 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   19 / 216846 3 / 960632 4 / 178606 0 / 85464 19 / 216846 3 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 2 / 354066 -- 5 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   15 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 15 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   -- 2 / 292212 -- 0 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 12 / 636203 -- 1 / 82470 -- 12 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891   4 / 615945   5 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   5 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   9 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 9 / 736319 --
thymus 3 / 100203   4 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740   4 / 25954 -- 8 / 262740 0 / 14058 4 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 5 / 212613 -- -- 4 / 531904 5 / 212613