Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.260227Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 132 / 3259021 5 / 403641 2310 / 25718729 23 / 491920 132 / 3259021 5 / 403641 2310 / 25718729 23 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 1 / 103390 -- 1 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 30 / 261599   1874 / 7554651 -- 30 / 261599 0 / 2128 1874 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 9 / 233710 8 / 43127 4 / 56549 -- 9 / 233710 8 / 43127
cerebrum 38 / 228104 -- -- -- 38 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 8 / 718928   118 / 2760977 -- 8 / 718928 0 / 9837 118 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 3 / 138066 -- 4 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 28 / 548222 -- 0 / 34979 -- 28 / 548222 --
heart   -- 8 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 8 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   40 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 40 / 1415985 --
limb   -- 12 / 595880 -- 0 / 16187 -- 12 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung     13 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 13 / 943009 --
lymph node   -- 7 / 344354 -- 0 / 14648 -- 7 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 3 / 216846 8 / 960632 13 / 178606 5 / 85464 3 / 216846 8 / 960632 13 / 178606
muscle 5 / 24130 -- 4 / 137075 -- 5 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 6 / 354066 -- 4 / 43149 -- 6 / 354066 --
pancreas     25 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 25 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 6 / 145854 -- 1 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 4 / 292212 -- 2 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate     20 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 20 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 31 / 636203 -- 1 / 82470 -- 31 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     25 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 25 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     7 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 7 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   13 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus 2 / 100203   5 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 5 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 4 / 262740 2 / 14058   -- 4 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 8 / 206823 -- 0 / 6854 -- 8 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 12 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 12 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 9 / 531904 2 / 212613 -- -- 9 / 531904 2 / 212613