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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.260117Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 946 / 3259021 45 / 403641 1252 / 25718729 3 / 491920 946 / 3259021 45 / 403641 1252 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 --   -- 4 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 6 / 100926 --   -- 6 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 118 / 261599   994 / 7554651 -- 118 / 261599 0 / 2128 994 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 29 / 56549 --   1 / 43127 29 / 56549 -- 0 / 233710 1 / 43127
cerebrum 348 / 228104 -- -- -- 348 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 160 / 718928 1 / 9837 42 / 2760977 -- 160 / 718928 1 / 9837 42 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 22 / 94929 -- 5 / 138066 -- 22 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 8 / 548222 -- 2 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 22 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 22 / 1231698 --
kidney 6 / 121184 1 / 2215 27 / 1415985 -- 6 / 121184 1 / 2215 27 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver 2 / 104633   2 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 6 / 26861 3 / 72516 25 / 943009 -- 6 / 26861 3 / 72516 25 / 943009 --
lymph node   -- 6 / 344354 -- 0 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 22 / 216846 5 / 960632   4 / 85464 22 / 216846 5 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 16 / 35780 -- -- -- 16 / 35780 -- -- --
ovary 46 / 43149 -- 3 / 354066 -- 46 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   24 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 24 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 3 / 145854 -- 4 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 4 / 37653 -- 6 / 292212 -- 4 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 19 / 99675 -- -- -- 19 / 99675 -- -- --
prostate     6 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina 26 / 82470 -- 10 / 636203 -- 26 / 82470 -- 10 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 20 / 85891 10 / 31511 9 / 615945 1 / 57574 20 / 85891 10 / 31511 9 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492   8 / 386635 -- 7 / 73492 0 / 17831 8 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach   -- 4 / 218318 -- 0 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   1 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 12 / 100203 4 / 20273 7 / 346181 -- 12 / 100203 4 / 20273 7 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 55 / 262740 3 / 14058   -- 55 / 262740 3 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 13 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 1 / 212613 -- -- 4 / 531904 1 / 212613