Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.259605Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 56 / 3259021 5 / 403641 81 / 25718729 3 / 491920 56 / 3259021 5 / 403641 81 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 1 / 64924 -- 2 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 4 / 100926 --   -- 4 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 7 / 261599   8 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 8 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 3 / 233710   0 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 16 / 718928   17 / 2760977 -- 16 / 718928 0 / 9837 17 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   -- 8 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 8 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 1 / 104633   2 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung   1 / 72516 5 / 943009 -- 0 / 26861 1 / 72516 5 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 1 / 344354 -- 2 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   3 / 216846 4 / 960632   0 / 85464 3 / 216846 4 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     2 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701     -- 1 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 9 / 636203 -- 1 / 82470 -- 9 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891 1 / 31511     4 / 85891 1 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   3 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 3 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987     -- 1 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus 1 / 100203   1 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740     -- 8 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --   3 / 212613 -- -- 0 / 531904 3 / 212613