Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.258910Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 280 / 3259021 25 / 403641 412 / 25718729 5 / 491920 280 / 3259021 25 / 403641 412 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 1 / 64924 -- 3 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 7 / 100926 -- 1 / 103390 -- 7 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 12 / 261599 3 / 2128 124 / 7554651 -- 12 / 261599 3 / 2128 124 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 18 / 228104 -- -- -- 18 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 49 / 718928 2 / 9837 38 / 2760977 -- 49 / 718928 2 / 9837 38 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 3 / 138066 -- 4 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 10 / 548222 -- 3 / 34979 -- 10 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 15 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 15 / 1231698 --
kidney 15 / 121184   16 / 1415985 -- 15 / 121184 0 / 2215 16 / 1415985 --
limb 8 / 16187 -- 8 / 595880 -- 8 / 16187 -- 8 / 595880 --
liver 4 / 104633   3 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 2 / 26861 3 / 72516 21 / 943009 -- 2 / 26861 3 / 72516 21 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 25 / 85464 10 / 216846 14 / 960632 3 / 178606 25 / 85464 10 / 216846 14 / 960632 3 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 2 / 137075 -- 2 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 7 / 354066 -- 0 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 14 / 75220   39 / 1338446 -- 14 / 75220 0 / 34 39 / 1338446 --
pancreatic islet 5 / 30771 -- -- -- 5 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 6 / 17986 -- 6 / 145854 -- 6 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 7 / 292212 -- 1 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   21 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 21 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 7 / 636203 -- 3 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland 5 / 18434   -- -- 5 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891 3 / 31511 4 / 615945   9 / 85891 3 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   4 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 5 / 218318 -- 2 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium 10 / 16875 -- -- -- 10 / 16875 -- -- --
testis 17 / 116987   11 / 736319 -- 17 / 116987 0 / 2634 11 / 736319 --
thymus 2 / 100203     -- 2 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 36 / 262740 4 / 14058   -- 36 / 262740 4 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 26 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 26 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 12 / 531904 2 / 212613 -- -- 12 / 531904 2 / 212613