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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.258Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 296 / 3259021 11 / 403641 9972 / 25718729 212 / 491920 296 / 3259021 11 / 403641 9972 / 25718729 212 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 13 / 64924 -- 0 / 38915 -- 13 / 64924 --
bone marrow   -- 30 / 103390 -- 0 / 100926 -- 30 / 103390 --
brain 7 / 261599   3680 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 3680 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 79 / 233710 21 / 43127 2 / 56549 -- 79 / 233710 21 / 43127
cerebrum 17 / 228104 -- -- -- 17 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 114 / 718928 1 / 9837 978 / 2760977 -- 114 / 718928 1 / 9837 978 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 61 / 211918 -- -- -- 61 / 211918 --
eye   -- 33 / 138066 -- 0 / 94929 -- 33 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 211 / 548222 -- 1 / 34979 -- 211 / 548222 --
heart 28 / 49793 -- 940 / 1231698 -- 28 / 49793 -- 940 / 1231698 --
kidney 42 / 121184   632 / 1415985 -- 42 / 121184 0 / 2215 632 / 1415985 --
limb   -- 133 / 595880 -- 0 / 16187 -- 133 / 595880 --
liver 10 / 104633   194 / 527425 -- 10 / 104633 0 / 6685 194 / 527425 --
lung 2 / 26861   216 / 943009 -- 2 / 26861 0 / 72516 216 / 943009 --
lymph node   -- 46 / 344354 -- 0 / 14648 -- 46 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 1 / 216846 165 / 960632 56 / 178606 8 / 85464 1 / 216846 165 / 960632 56 / 178606
muscle 4 / 24130 -- 100 / 137075 -- 4 / 24130 -- 100 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 64 / 354066 -- 1 / 43149 -- 64 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   506 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 506 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 88 / 145854 -- 0 / 17986 -- 88 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 102 / 292212 -- 2 / 37653 -- 102 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   94 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 94 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 271 / 636203 -- 4 / 82470 -- 271 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   196 / 615945 6 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 196 / 615945 6 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492 4 / 17831 100 / 386635 -- 1 / 73492 4 / 17831 100 / 386635 --
stem cell -- -- 93 / 234473 -- -- -- 93 / 234473 --
stomach 6 / 21241 -- 64 / 218318 -- 6 / 21241 -- 64 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987   114 / 736319 -- 7 / 116987 0 / 2634 114 / 736319 --
thymus 1 / 100203 3 / 20273 77 / 346181 -- 1 / 100203 3 / 20273 77 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 12 / 262740 2 / 14058 15 / 25954 -- 12 / 262740 2 / 14058 15 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 38 / 206823 -- 1 / 6854 -- 38 / 206823 --
vascular   -- 264 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 264 / 1092595 --
white blood cells -- -- 112 / 398838 -- -- -- 112 / 398838 --
whole body -- -- 263 / 531904 129 / 212613 -- -- 263 / 531904 129 / 212613