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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.254438Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 181 / 3259021 15 / 403641 5085 / 25718729 158 / 491920 181 / 3259021 15 / 403641 5085 / 25718729 158 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 -- 1 / 64924 -- 5 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 27 / 261599 1 / 2128 752 / 7554651 -- 27 / 261599 1 / 2128 752 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 7 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 7 / 233710 1 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 64 / 718928   966 / 2760977 -- 64 / 718928 0 / 9837 966 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 35 / 211918 -- -- -- 35 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 55 / 138066 -- 7 / 94929 -- 55 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 69 / 548222 -- 0 / 34979 -- 69 / 548222 --
heart   -- 296 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 296 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   441 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 441 / 1415985 --
limb   -- 155 / 595880 -- 0 / 16187 -- 155 / 595880 --
liver     41 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 41 / 527425 --
lung   4 / 72516 530 / 943009 -- 0 / 26861 4 / 72516 530 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 31 / 344354 -- 1 / 14648 -- 31 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 8 / 216846 134 / 960632 77 / 178606 4 / 85464 8 / 216846 134 / 960632 77 / 178606
muscle   -- 18 / 137075 -- 0 / 24130 -- 18 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 13 / 43149 -- 127 / 354066 -- 13 / 43149 -- 127 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   171 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 171 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 10 / 145854 -- 0 / 17986 -- 10 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 38 / 292212 -- 3 / 37653 -- 38 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   88 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 88 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 89 / 636203 -- 8 / 82470 -- 89 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 1 / 31511 73 / 615945 15 / 57574 3 / 85891 1 / 31511 73 / 615945 15 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   107 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 107 / 386635 --
stem cell -- -- 14 / 234473 -- -- -- 14 / 234473 --
stomach   -- 61 / 218318 -- 0 / 21241 -- 61 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 8 / 116987 1 / 2634 223 / 736319 -- 8 / 116987 1 / 2634 223 / 736319 --
thymus 8 / 100203   62 / 346181 -- 8 / 100203 0 / 20273 62 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 7 / 262740   1 / 25954 -- 7 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 102 / 206823 -- 0 / 6854 -- 102 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 308 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 308 / 1092595 --
white blood cells -- -- 21 / 398838 -- -- -- 21 / 398838 --
whole body -- -- 59 / 531904 65 / 212613 -- -- 59 / 531904 65 / 212613