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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.254144Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 185 / 3259021 38 / 403641 681 / 25718729 13 / 491920 185 / 3259021 38 / 403641 681 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 4 / 64924 -- 1 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 10 / 103390 -- 2 / 100926 -- 10 / 103390 --
brain 35 / 261599   287 / 7554651 -- 35 / 261599 0 / 2128 287 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 9 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 9 / 233710 1 / 43127
cerebrum 12 / 228104 -- -- -- 12 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 5 / 51804   -- -- 5 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 32 / 718928   42 / 2760977 -- 32 / 718928 0 / 9837 42 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 5 / 94929 -- 3 / 138066 -- 5 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 9 / 548222 -- 0 / 34979 -- 9 / 548222 --
heart   -- 6 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 6 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   11 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 11 / 1415985 --
limb   -- 15 / 595880 -- 0 / 16187 -- 15 / 595880 --
liver 4 / 104633   7 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung 1 / 26861 6 / 72516 7 / 943009 -- 1 / 26861 6 / 72516 7 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 21 / 344354 -- 2 / 14648 -- 21 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 21 / 216846 24 / 960632 2 / 178606 8 / 85464 21 / 216846 24 / 960632 2 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 1 / 137075 -- 3 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 --   -- 1 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   24 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 24 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 4 / 9981 -- -- -- 4 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 2 / 292212 -- 2 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate     8 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 8 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 8 / 636203 -- 3 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891   12 / 615945 3 / 57574 4 / 85891 0 / 31511 12 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492 3 / 17831 15 / 386635 -- 7 / 73492 3 / 17831 15 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach   -- 7 / 218318 -- 0 / 21241 -- 7 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 12 / 100203 3 / 20273 13 / 346181 -- 12 / 100203 3 / 20273 13 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 14 / 262740 5 / 14058 4 / 25954 -- 14 / 262740 5 / 14058 4 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 69 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 69 / 1092595 --
white blood cells -- -- 53 / 398838 -- -- -- 53 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 7 / 212613 -- -- 4 / 531904 7 / 212613