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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.252034Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 166 / 3259021 6 / 403641 528 / 25718729 19 / 491920 166 / 3259021 6 / 403641 528 / 25718729 19 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 1 / 64924 -- 2 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 2 / 103390 -- 2 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 22 / 261599   160 / 7554651 -- 22 / 261599 0 / 2128 160 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 19 / 233710 7 / 43127 5 / 56549 -- 19 / 233710 7 / 43127
cerebrum 9 / 228104 -- -- -- 9 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 22 / 718928   24 / 2760977 -- 22 / 718928 0 / 9837 24 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 3 / 34979 -- 8 / 548222 -- 3 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney 8 / 121184   81 / 1415985 -- 8 / 121184 0 / 2215 81 / 1415985 --
limb 7 / 16187 -- 5 / 595880 -- 7 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver 7 / 104633   9 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 9 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516 18 / 943009 -- 1 / 26861 3 / 72516 18 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 3 / 344354 -- 1 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 3 / 216846 38 / 960632 6 / 178606 12 / 85464 3 / 216846 38 / 960632 6 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 2 / 137075 -- 2 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 11 / 43149 -- 2 / 354066 -- 11 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   5 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 2 / 145854 -- 1 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 2 / 37653 --   -- 2 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   6 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 45 / 636203 -- 2 / 82470 -- 45 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891   7 / 615945 2 / 57574 3 / 85891 0 / 31511 7 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   12 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 12 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 2 / 21241 --   -- 2 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   5 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 10 / 100203   5 / 346181 -- 10 / 100203 0 / 20273 5 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740     -- 8 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 7 / 206823 -- 0 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 20 / 398838 -- -- -- 20 / 398838 --
whole body -- -- 16 / 531904 4 / 212613 -- -- 16 / 531904 4 / 212613