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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.250703Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 228 / 3259021 20 / 403641 2127 / 25718729 36 / 491920 228 / 3259021 20 / 403641 2127 / 25718729 36 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 5 / 64924 -- 3 / 38915 -- 5 / 64924 --
bone marrow   -- 7 / 103390 -- 0 / 100926 -- 7 / 103390 --
brain 88 / 261599   640 / 7554651 -- 88 / 261599 0 / 2128 640 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 37 / 233710 1 / 43127 8 / 56549 -- 37 / 233710 1 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 25 / 718928   324 / 2760977 -- 25 / 718928 0 / 9837 324 / 2760977 --
endocrine 6 / 2473 -- -- -- 6 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 11 / 211918 -- -- -- 11 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 14 / 138066 -- 7 / 94929 -- 14 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 76 / 548222 -- 1 / 34979 -- 76 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 98 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 98 / 1231698 --
kidney 4 / 121184   75 / 1415985 -- 4 / 121184 0 / 2215 75 / 1415985 --
limb   -- 52 / 595880 -- 0 / 16187 -- 52 / 595880 --
liver 1 / 104633 1 / 6685 21 / 527425 -- 1 / 104633 1 / 6685 21 / 527425 --
lung 1 / 26861 8 / 72516 121 / 943009 -- 1 / 26861 8 / 72516 121 / 943009 --
lymph node   -- 22 / 344354 -- 0 / 14648 -- 22 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 9 / 216846 38 / 960632 12 / 178606 1 / 85464 9 / 216846 38 / 960632 12 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 12 / 137075 -- 3 / 24130 -- 12 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 26 / 354066 -- 2 / 43149 -- 26 / 354066 --
pancreas     88 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 88 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 14 / 145854 -- 0 / 17986 -- 14 / 145854 --
placenta   -- 29 / 292212 -- 0 / 37653 -- 29 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate     32 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 32 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 42 / 636203 -- 8 / 82470 -- 42 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 2 / 31511 54 / 615945 5 / 57574 6 / 85891 2 / 31511 54 / 615945 5 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     36 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 36 / 386635 --
stem cell -- -- 22 / 234473 -- -- -- 22 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 19 / 218318 -- 1 / 21241 -- 19 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   47 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 47 / 736319 --
thymus 11 / 100203   47 / 346181 -- 11 / 100203 0 / 20273 47 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 262740     -- 9 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 13 / 206823 -- 0 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular   -- 59 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 59 / 1092595 --
white blood cells -- -- 24 / 398838 -- -- -- 24 / 398838 --
whole body -- -- 22 / 531904 18 / 212613 -- -- 22 / 531904 18 / 212613