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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.250193Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 142 / 3259021 9 / 403641 688 / 25718729 14 / 491920 142 / 3259021 9 / 403641 688 / 25718729 14 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 2 / 103390 -- 3 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 14 / 261599   294 / 7554651 -- 14 / 261599 0 / 2128 294 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 4 / 233710   1 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 10 / 228104 -- -- -- 10 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 21 / 718928   45 / 2760977 -- 21 / 718928 0 / 9837 45 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 4 / 548222 -- 0 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart   -- 19 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney     6 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 6 / 1415985 --
limb 26 / 16187 -- 8 / 595880 -- 26 / 16187 -- 8 / 595880 --
liver 1 / 104633   7 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung   3 / 72516 18 / 943009 -- 0 / 26861 3 / 72516 18 / 943009 --
lymph node   -- 17 / 344354 -- 0 / 14648 -- 17 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 6 / 216846 25 / 960632 1 / 178606 4 / 85464 6 / 216846 25 / 960632 1 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 3 / 137075 -- 1 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 8 / 354066 -- 0 / 43149 -- 8 / 354066 --
pancreas     10 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 10 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 11 / 292212 -- 2 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 3 / 636203 -- 2 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 5 / 85891   29 / 615945 6 / 57574 5 / 85891 0 / 31511 29 / 615945 6 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     9 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach   -- 4 / 218318 -- 0 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium 41 / 16875 -- -- -- 41 / 16875 -- -- --
testis     19 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 19 / 736319 --
thymus     2 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid 2 / 8821 -- -- -- 2 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 1 / 262740     -- 1 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 110 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 110 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 12 / 531904 7 / 212613 -- -- 12 / 531904 7 / 212613