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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.249977Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 34 / 3259021   270 / 25718729 2 / 491920 34 / 3259021 0 / 403641 270 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 7 / 261599   105 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 105 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 6 / 233710   0 / 56549 -- 6 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 9 / 718928   42 / 2760977 -- 9 / 718928 0 / 9837 42 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 2 / 138066 -- 2 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 8 / 548222 -- 0 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart   -- 16 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 16 / 1231698 --
kidney     13 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 13 / 1415985 --
limb   -- 12 / 595880 -- 0 / 16187 -- 12 / 595880 --
liver     4 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung 2 / 26861   12 / 943009 -- 2 / 26861 0 / 72516 12 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464   1 / 960632 1 / 178606 1 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 2 / 354066 -- 1 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     4 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 4 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina   -- 8 / 636203 -- 0 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     1 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     3 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 3 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 6 / 218318 -- 0 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     5 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 2 / 100203   3 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740     -- 2 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 1 / 212613 -- -- 2 / 531904 1 / 212613