Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.249966Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 527 / 3259021 66 / 403641 1384 / 25718729 12 / 491920 527 / 3259021 66 / 403641 1384 / 25718729 12 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 -- 4 / 64924 -- 5 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 9 / 100926 -- 17 / 103390 -- 9 / 100926 -- 17 / 103390 --
brain 37 / 261599   239 / 7554651 -- 37 / 261599 0 / 2128 239 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 11 / 56549 -- 10 / 233710 2 / 43127 11 / 56549 -- 10 / 233710 2 / 43127
cerebrum 19 / 228104 -- -- -- 19 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804   -- -- 7 / 51804 0 / 689 -- --
ear 32 / 39315 -- -- -- 32 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 48 / 718928 4 / 9837 140 / 2760977 -- 48 / 718928 4 / 9837 140 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 18 / 211918 -- -- -- 18 / 211918 --
eye 8 / 94929 -- 5 / 138066 -- 8 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract 10 / 34979 -- 25 / 548222 -- 10 / 34979 -- 25 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 46 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 46 / 1231698 --
kidney 13 / 121184   48 / 1415985 -- 13 / 121184 0 / 2215 48 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 29 / 595880 -- 1 / 16187 -- 29 / 595880 --
liver 22 / 104633   9 / 527425 -- 22 / 104633 0 / 6685 9 / 527425 --
lung 13 / 26861 9 / 72516 65 / 943009 -- 13 / 26861 9 / 72516 65 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 38 / 344354 -- 2 / 14648 -- 38 / 344354 --
lymphoreticular   5 / 5421 -- -- 0 / 3137 5 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 39 / 216846 64 / 960632 5 / 178606 7 / 85464 39 / 216846 64 / 960632 5 / 178606
muscle 6 / 24130 -- 7 / 137075 -- 6 / 24130 -- 7 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary 9 / 43149 -- 6 / 354066 -- 9 / 43149 -- 6 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   55 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 55 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 8 / 37653 -- 26 / 292212 -- 8 / 37653 -- 26 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate     22 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 22 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 11 / 636203 -- 4 / 82470 -- 11 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 57 / 85891 2 / 31511 35 / 615945 2 / 57574 57 / 85891 2 / 31511 35 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 42 / 73492 4 / 17831 19 / 386635 -- 42 / 73492 4 / 17831 19 / 386635 --
stem cell -- -- 11 / 234473 -- -- -- 11 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 9 / 218318 -- 2 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 11 / 116987   29 / 736319 -- 11 / 116987 0 / 2634 29 / 736319 --
thymus 12 / 100203 1 / 20273 16 / 346181 -- 12 / 100203 1 / 20273 16 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 100 / 262740 2 / 14058 1 / 25954 -- 100 / 262740 2 / 14058 1 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 8 / 206823 -- 2 / 6854 -- 8 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 324 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 324 / 1092595 --
white blood cells -- -- 39 / 398838 -- -- -- 39 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904 3 / 212613 -- -- 7 / 531904 3 / 212613