Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.248492Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 378 / 3259021 58 / 403641 477 / 25718729 4 / 491920 378 / 3259021 58 / 403641 477 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 58 / 100926 --   -- 58 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 12 / 261599   141 / 7554651 -- 12 / 261599 0 / 2128 141 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 3 / 233710   8 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 17 / 228104 -- -- -- 17 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 90 / 718928 1 / 9837 56 / 2760977 -- 90 / 718928 1 / 9837 56 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 6 / 138066 -- 4 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 8 / 548222 -- 1 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 31 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 31 / 1231698 --
kidney 10 / 121184   28 / 1415985 -- 10 / 121184 0 / 2215 28 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 15 / 104633 3 / 6685 9 / 527425 -- 15 / 104633 3 / 6685 9 / 527425 --
lung 1 / 26861 17 / 72516 20 / 943009 -- 1 / 26861 17 / 72516 20 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 2 / 344354 -- 1 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 14 / 85464 28 / 216846 17 / 960632 1 / 178606 14 / 85464 28 / 216846 17 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 13 / 75220   26 / 1338446 -- 13 / 75220 0 / 34 26 / 1338446 --
pancreatic islet 9 / 30771 -- -- -- 9 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 7 / 17986 -- 6 / 145854 -- 7 / 17986 -- 6 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 4 / 292212 -- 3 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate     15 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 15 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 11 / 636203 -- 4 / 82470 -- 11 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 15 / 85891 3 / 31511 7 / 615945   15 / 85891 3 / 31511 7 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 15 / 73492 2 / 17831 5 / 386635 -- 15 / 73492 2 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 4 / 218318 -- 1 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 11 / 116987 2 / 2634 15 / 736319 -- 11 / 116987 2 / 2634 15 / 736319 --
thymus 12 / 100203   9 / 346181 -- 12 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 32 / 262740 2 / 14058   -- 32 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 12 / 206823 -- 0 / 6854 -- 12 / 206823 --
vascular   -- 9 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 9 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 13 / 531904 3 / 212613 -- -- 13 / 531904 3 / 212613