Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.248037Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 51 / 3259021 8 / 403641 274 / 25718729 10 / 491920 51 / 3259021 8 / 403641 274 / 25718729 10 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 15 / 261599   95 / 7554651 -- 15 / 261599 0 / 2128 95 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 9 / 233710 2 / 43127 0 / 56549 -- 9 / 233710 2 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 10 / 718928   19 / 2760977 -- 10 / 718928 0 / 9837 19 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 8 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 8 / 1231698 --
kidney     9 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 9 / 1415985 --
limb   -- 3 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3 / 595880 --
liver 2 / 104633   3 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung     2 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 2 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 6 / 216846 20 / 960632 5 / 178606 1 / 85464 6 / 216846 20 / 960632 5 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 3 / 354066 -- 1 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   10 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 10 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 3 / 292212 -- 2 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 28 / 636203 -- 4 / 82470 -- 28 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 2 / 31511 18 / 615945 2 / 57574 1 / 85891 2 / 31511 18 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492     -- 1 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 1 / 21241 --   -- 1 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     10 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 10 / 736319 --
thymus     2 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 1 / 212613 -- -- 3 / 531904 1 / 212613