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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.247143Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 97 / 3259021 21 / 403641 312 / 25718729 7 / 491920 97 / 3259021 21 / 403641 312 / 25718729 7 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 1 / 103390 -- 1 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 7 / 261599   90 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 90 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 8 / 51804   -- -- 8 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 16 / 718928   28 / 2760977 -- 16 / 718928 0 / 9837 28 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 1 / 138066 -- 3 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 4 / 34979 -- 16 / 548222 -- 4 / 34979 -- 16 / 548222 --
heart   -- 14 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 14 / 1231698 --
kidney     15 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 15 / 1415985 --
limb   -- 11 / 595880 -- 0 / 16187 -- 11 / 595880 --
liver 5 / 104633   4 / 527425 -- 5 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung 2 / 26861 6 / 72516 5 / 943009 -- 2 / 26861 6 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 6 / 216846 16 / 960632 4 / 178606 1 / 85464 6 / 216846 16 / 960632 4 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 2 / 354066 -- 3 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   17 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 17 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 7 / 292212 -- 0 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 5 / 23701   32 / 386047 -- 5 / 23701 0 / 5 32 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 2 / 636203 -- 1 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891 6 / 31511 4 / 615945 2 / 57574 2 / 85891 6 / 31511 4 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen   1 / 17831 2 / 386635 -- 0 / 73492 1 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 4 / 218318 -- 1 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   4 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus 6 / 100203   3 / 346181 -- 6 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 10 / 262740 2 / 14058   -- 10 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 14 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 14 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904 1 / 212613 -- -- 7 / 531904 1 / 212613