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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.245746Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 800 / 3259021 37 / 403641 1388 / 25718729 11 / 491920 800 / 3259021 37 / 403641 1388 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 15 / 38915 -- 4 / 64924 -- 15 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 10 / 100926 -- 2 / 103390 -- 10 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 25 / 261599   146 / 7554651 -- 25 / 261599 0 / 2128 146 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 20 / 233710   2 / 56549 -- 20 / 233710 0 / 43127
cerebrum 15 / 228104 -- -- -- 15 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 213 / 718928 1 / 9837 291 / 2760977 -- 213 / 718928 1 / 9837 291 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 28 / 94929 -- 11 / 138066 -- 28 / 94929 -- 11 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 30 / 548222 -- 0 / 34979 -- 30 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 147 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 147 / 1231698 --
kidney 31 / 121184   103 / 1415985 -- 31 / 121184 0 / 2215 103 / 1415985 --
limb   -- 43 / 595880 -- 0 / 16187 -- 43 / 595880 --
liver 9 / 104633   21 / 527425 -- 9 / 104633 0 / 6685 21 / 527425 --
lung 7 / 26861 6 / 72516 74 / 943009 -- 7 / 26861 6 / 72516 74 / 943009 --
lymph node   -- 9 / 344354 -- 0 / 14648 -- 9 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 9 / 85464 17 / 216846 23 / 960632 1 / 178606 9 / 85464 17 / 216846 23 / 960632 1 / 178606
muscle 4 / 24130 -- 18 / 137075 -- 4 / 24130 -- 18 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 160 / 43149 -- 39 / 354066 -- 160 / 43149 -- 39 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   48 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 48 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 4 / 145854 -- 4 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 7 / 292212 -- 2 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 19 / 99675 -- -- -- 19 / 99675 -- -- --
prostate 3 / 23701   20 / 386047 -- 3 / 23701 0 / 5 20 / 386047 --
retina 18 / 82470 -- 33 / 636203 -- 18 / 82470 -- 33 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 13 / 85891 4 / 31511 37 / 615945 2 / 57574 13 / 85891 4 / 31511 37 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492   19 / 386635 -- 8 / 73492 0 / 17831 19 / 386635 --
stem cell -- -- 11 / 234473 -- -- -- 11 / 234473 --
stomach   -- 15 / 218318 -- 0 / 21241 -- 15 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 16 / 116987   62 / 736319 -- 16 / 116987 0 / 2634 62 / 736319 --
thymus 4 / 100203 2 / 20273 35 / 346181 -- 4 / 100203 2 / 20273 35 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 165 / 262740 6 / 14058   -- 165 / 262740 6 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 21 / 206823 -- 0 / 6854 -- 21 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 61 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 61 / 1092595 --
white blood cells -- -- 24 / 398838 -- -- -- 24 / 398838 --
whole body -- -- 9 / 531904 8 / 212613 -- -- 9 / 531904 8 / 212613