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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.245724Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 616 / 3259021 103 / 403641 2710 / 25718729 31 / 491920 616 / 3259021 103 / 403641 2710 / 25718729 31 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 -- 4 / 64924 -- 5 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 16 / 100926 -- 1 / 103390 -- 16 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 6 / 261599   179 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 179 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 6 / 233710 1 / 43127 0 / 56549 -- 6 / 233710 1 / 43127
cerebrum 48 / 228104 -- -- -- 48 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 11 / 51804   -- -- 11 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 105 / 718928   215 / 2760977 -- 105 / 718928 0 / 9837 215 / 2760977 --
endocrine 2 / 2473 -- -- -- 2 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 15 / 211918 -- -- -- 15 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 2 / 138066 -- 1 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 96 / 548222 -- 1 / 34979 -- 96 / 548222 --
heart 35 / 49793 -- 178 / 1231698 -- 35 / 49793 -- 178 / 1231698 --
kidney 61 / 121184   268 / 1415985 -- 61 / 121184 0 / 2215 268 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 60 / 595880 -- 2 / 16187 -- 60 / 595880 --
liver 162 / 104633 6 / 6685 347 / 527425 -- 162 / 104633 6 / 6685 347 / 527425 --
lung 5 / 26861 14 / 72516 151 / 943009 -- 5 / 26861 14 / 72516 151 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 28 / 344354 -- 1 / 14648 -- 28 / 344354 --
lymphoreticular 2 / 3137 2 / 5421 -- -- 2 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 20 / 85464 32 / 216846 199 / 960632 17 / 178606 20 / 85464 32 / 216846 199 / 960632 17 / 178606
muscle 12 / 24130 -- 35 / 137075 -- 12 / 24130 -- 35 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 7 / 43149 -- 64 / 354066 -- 7 / 43149 -- 64 / 354066 --
pancreas 9 / 75220   93 / 1338446 -- 9 / 75220 0 / 34 93 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 10 / 145854 -- 3 / 17986 -- 10 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 7 / 292212 -- 2 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 19 / 99675 -- -- -- 19 / 99675 -- -- --
prostate 6 / 23701   68 / 386047 -- 6 / 23701 0 / 5 68 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 13 / 636203 -- 2 / 82470 -- 13 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434   -- -- 3 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891 8 / 31511 130 / 615945 3 / 57574 2 / 85891 8 / 31511 130 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492 7 / 17831 34 / 386635 -- 3 / 73492 7 / 17831 34 / 386635 --
stem cell -- -- 8 / 234473 -- -- -- 8 / 234473 --
stomach 12 / 21241 -- 32 / 218318 -- 12 / 21241 -- 32 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987 1 / 2634 195 / 736319 -- 1 / 116987 1 / 2634 195 / 736319 --
thymus 6 / 100203 24 / 20273 44 / 346181 -- 6 / 100203 24 / 20273 44 / 346181 --
thyroid 9 / 8821 -- -- -- 9 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 25 / 262740 9 / 14058   -- 25 / 262740 9 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 23 / 206823 -- 0 / 6854 -- 23 / 206823 --
vascular 6 / 12366 -- 58 / 1092595 -- 6 / 12366 -- 58 / 1092595 --
white blood cells -- -- 14 / 398838 -- -- -- 14 / 398838 --
whole body -- -- 133 / 531904 10 / 212613 -- -- 133 / 531904 10 / 212613