Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2444Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 194 / 3259021 73 / 403641 330 / 25718729 9 / 491920 194 / 3259021 73 / 403641 330 / 25718729 9 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 6 / 100926 --   -- 6 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 7 / 261599   35 / 7554651 -- 7 / 261599 0 / 2128 35 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 2 / 233710   3 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 71 / 718928   60 / 2760977 -- 71 / 718928 0 / 9837 60 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 1 / 138066 -- 3 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 8 / 548222 -- 1 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 7 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   17 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 17 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 10 / 595880 -- 2 / 16187 -- 10 / 595880 --
liver 7 / 104633   4 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung 1 / 26861 21 / 72516 11 / 943009 -- 1 / 26861 21 / 72516 11 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 3 / 344354 -- 1 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular 1 / 3137 1 / 5421 -- -- 1 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 37 / 216846 31 / 960632 4 / 178606 8 / 85464 37 / 216846 31 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 2 / 137075 -- 0 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 8 / 354066 -- 0 / 43149 -- 8 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   9 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 1 / 292212 -- 1 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 3 / 636203 -- 1 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 10 / 85891 2 / 31511 16 / 615945 2 / 57574 10 / 85891 2 / 31511 16 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 24 / 73492 4 / 17831 6 / 386635 -- 24 / 73492 4 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   -- 4 / 218318 -- 0 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     3 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 3 / 736319 --
thymus 18 / 100203 4 / 20273 17 / 346181 -- 18 / 100203 4 / 20273 17 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 13 / 262740 4 / 14058   -- 13 / 262740 4 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 11 / 206823 -- 0 / 6854 -- 11 / 206823 --
vascular   -- 25 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 25 / 1092595 --
white blood cells -- -- 20 / 398838 -- -- -- 20 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 3 / 212613 -- -- 4 / 531904 3 / 212613