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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.24250Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 150 / 3259021 17 / 403641 115 / 25718729 3 / 491920 150 / 3259021 17 / 403641 115 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 9 / 38915 --   -- 9 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 15 / 261599   34 / 7554651 -- 15 / 261599 0 / 2128 34 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 1 / 233710   3 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 55 / 718928 1 / 9837 17 / 2760977 -- 55 / 718928 1 / 9837 17 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 12 / 94929 --   -- 12 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 3 / 548222 -- 1 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 7 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney     9 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 9 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung   5 / 72516 10 / 943009 -- 0 / 26861 5 / 72516 10 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 1 / 344354 -- 1 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 10 / 216846 2 / 960632 3 / 178606 2 / 85464 10 / 216846 2 / 960632 3 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 1 / 354066 -- 2 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   5 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 3 / 3907 -- -- -- 3 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 7 / 82470 -- 1 / 636203 -- 7 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   1 / 615945   1 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492     -- 4 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   2 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 6 / 100203     -- 6 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 12 / 262740 1 / 14058   -- 12 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904   -- -- 1 / 531904 0 / 212613