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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.2408Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 151 / 3259021 7 / 403641 1100 / 25718729 27 / 491920 151 / 3259021 7 / 403641 1100 / 25718729 27 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 -- 1 / 64924 -- 4 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 10 / 100926 -- 6 / 103390 -- 10 / 100926 -- 6 / 103390 --
brain 4 / 261599   321 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 321 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 27 / 233710 1 / 43127 2 / 56549 -- 27 / 233710 1 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 1 / 718928   134 / 2760977 -- 1 / 718928 0 / 9837 134 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 10 / 138066 -- 1 / 94929 -- 10 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 9 / 548222 -- 0 / 34979 -- 9 / 548222 --
heart   -- 58 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 58 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   51 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 51 / 1415985 --
limb   -- 36 / 595880 -- 0 / 16187 -- 36 / 595880 --
liver     11 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 11 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 32 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 32 / 943009 --
lymph node   -- 6 / 344354 -- 0 / 14648 -- 6 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 5 / 216846 38 / 960632 7 / 178606 3 / 85464 5 / 216846 38 / 960632 7 / 178606
muscle   -- 9 / 137075 -- 0 / 24130 -- 9 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 10 / 354066 -- 0 / 43149 -- 10 / 354066 --
pancreas     56 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 56 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 7 / 145854 -- 2 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta   -- 5 / 292212 -- 0 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     16 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 16 / 386047 --
retina   -- 56 / 636203 -- 0 / 82470 -- 56 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 34 / 85891   26 / 615945 1 / 57574 34 / 85891 0 / 31511 26 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     18 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 18 / 386635 --
stem cell -- -- 10 / 234473 -- -- -- 10 / 234473 --
stomach   -- 11 / 218318 -- 0 / 21241 -- 11 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     29 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 29 / 736319 --
thymus 3 / 100203   24 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 24 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 77 / 262740   1 / 25954 -- 77 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 13 / 206823 -- 0 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular   -- 48 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 48 / 1092595 --
white blood cells -- -- 9 / 398838 -- -- -- 9 / 398838 --
whole body -- -- 10 / 531904 18 / 212613 -- -- 10 / 531904 18 / 212613