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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.240329Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 215 / 3259021 29 / 403641 306 / 25718729 5 / 491920 215 / 3259021 29 / 403641 306 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 8 / 100926 -- 1 / 103390 -- 8 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 15 / 261599   111 / 7554651 -- 15 / 261599 0 / 2128 111 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 1 / 233710 2 / 43127 1 / 56549 -- 1 / 233710 2 / 43127
cerebrum 2 / 228104 -- -- -- 2 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 68 / 718928 2 / 9837 21 / 2760977 -- 68 / 718928 2 / 9837 21 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 18 / 94929 -- 3 / 138066 -- 18 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 2 / 548222 -- 1 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 9 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 9 / 1231698 --
kidney 12 / 121184   3 / 1415985 -- 12 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 8 / 595880 -- 0 / 16187 -- 8 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 1 / 26861 5 / 72516 7 / 943009 -- 1 / 26861 5 / 72516 7 / 943009 --
lymph node 5 / 14648 -- 4 / 344354 -- 5 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 18 / 216846 9 / 960632   2 / 85464 18 / 216846 9 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 8 / 354066 -- 3 / 43149 -- 8 / 354066 --
pancreas 6 / 75220   16 / 1338446 -- 6 / 75220 0 / 34 16 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 8 / 82470 -- 8 / 636203 -- 8 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 6 / 85891 4 / 31511 8 / 615945 2 / 57574 6 / 85891 4 / 31511 8 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 6 / 73492   4 / 386635 -- 6 / 73492 0 / 17831 4 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach   -- 4 / 218318 -- 0 / 21241 -- 4 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 19 / 116987   12 / 736319 -- 19 / 116987 0 / 2634 12 / 736319 --
thymus 13 / 100203   6 / 346181 -- 13 / 100203 0 / 20273 6 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 13 / 262740     -- 13 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular   -- 32 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 32 / 1092595 --
white blood cells -- -- 7 / 398838 -- -- -- 7 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904 1 / 212613 -- -- 5 / 531904 1 / 212613