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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.23942Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 58 / 3259021 5 / 403641 77 / 25718729 5 / 491920 58 / 3259021 5 / 403641 77 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 --   -- 3 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   -- 1 / 103390 -- 0 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain     3 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 3 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 --     1 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 3 / 718928   6 / 2760977 -- 3 / 718928 0 / 9837 6 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney     2 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver 10 / 104633 3 / 6685 13 / 527425 -- 10 / 104633 3 / 6685 13 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 1 / 344354 -- 2 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   2 / 216846 4 / 960632 4 / 178606 0 / 85464 2 / 216846 4 / 960632 4 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 1 / 137075 -- 2 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 -- 1 / 354066 -- 2 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     10 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 10 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate 4 / 23701   11 / 386047 -- 4 / 23701 0 / 5 11 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891     1 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   2 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 8 / 116987   6 / 736319 -- 8 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 12 / 262740     -- 12 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 --   -- 1 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904   -- -- 3 / 531904 0 / 212613