Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.238841Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 292 / 3259021 13 / 403641 1689 / 25718729 34 / 491920 292 / 3259021 13 / 403641 1689 / 25718729 34 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 1 / 64924 -- 2 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 30 / 100926 -- 15 / 103390 -- 30 / 100926 -- 15 / 103390 --
brain 28 / 261599   641 / 7554651 -- 28 / 261599 0 / 2128 641 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 14 / 56549 -- 69 / 233710 4 / 43127 14 / 56549 -- 69 / 233710 4 / 43127
cerebrum 45 / 228104 -- -- -- 45 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 53 / 718928   138 / 2760977 -- 53 / 718928 0 / 9837 138 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 11 / 211918 -- -- -- 11 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 11 / 138066 -- 4 / 94929 -- 11 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 32 / 548222 -- 1 / 34979 -- 32 / 548222 --
heart   -- 53 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 53 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   34 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 34 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 32 / 595880 -- 2 / 16187 -- 32 / 595880 --
liver 2 / 104633   7 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516 43 / 943009 -- 1 / 26861 3 / 72516 43 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 41 / 344354 -- 2 / 14648 -- 41 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 6 / 216846 17 / 960632 4 / 178606 6 / 85464 6 / 216846 17 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary 7 / 43149 -- 17 / 354066 -- 7 / 43149 -- 17 / 354066 --
pancreas 22 / 75220   39 / 1338446 -- 22 / 75220 0 / 34 39 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 3 / 9981 -- -- -- 3 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 3 / 292212 -- 2 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   19 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 19 / 386047 --
retina 12 / 82470 -- 179 / 636203 -- 12 / 82470 -- 179 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891 3 / 31511 12 / 615945 2 / 57574 2 / 85891 3 / 31511 12 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   17 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 17 / 386635 --
stem cell -- -- 10 / 234473 -- -- -- 10 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 17 / 218318 -- 2 / 21241 -- 17 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987   33 / 736319 -- 7 / 116987 0 / 2634 33 / 736319 --
thymus 17 / 100203   24 / 346181 -- 17 / 100203 0 / 20273 24 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 7 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 -- 7 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 7 / 206823 -- 1 / 6854 -- 7 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 24 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 24 / 1092595 --
white blood cells -- -- 124 / 398838 -- -- -- 124 / 398838 --
whole body -- -- 11 / 531904 24 / 212613 -- -- 11 / 531904 24 / 212613