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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.238213Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 248 / 3259021 50 / 403641 593 / 25718729 1 / 491920 248 / 3259021 50 / 403641 593 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 4 / 64924 -- 0 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 1 / 103390 -- 5 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 20 / 261599   228 / 7554651 -- 20 / 261599 0 / 2128 228 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 1 / 233710   8 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 33 / 228104 -- -- -- 33 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804 1 / 689 -- -- 1 / 51804 1 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 31 / 718928   58 / 2760977 -- 31 / 718928 0 / 9837 58 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye 9 / 94929 -- 3 / 138066 -- 9 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 5 / 548222 -- 2 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 12 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 12 / 1231698 --
kidney 2 / 121184 1 / 2215 25 / 1415985 -- 2 / 121184 1 / 2215 25 / 1415985 --
limb 3 / 16187 -- 11 / 595880 -- 3 / 16187 -- 11 / 595880 --
liver 3 / 104633   16 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 16 / 527425 --
lung 1 / 26861 9 / 72516 31 / 943009 -- 1 / 26861 9 / 72516 31 / 943009 --
lymph node   -- 3 / 344354 -- 0 / 14648 -- 3 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 25 / 216846 23 / 960632   8 / 85464 25 / 216846 23 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 --   -- 1 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 10 / 43149 -- 2 / 354066 -- 10 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   18 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 18 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 17 / 292212 -- 2 / 37653 -- 17 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate 5 / 23701   15 / 386047 -- 5 / 23701 0 / 5 15 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 3 / 636203 -- 2 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 12 / 85891 9 / 31511 5 / 615945 1 / 57574 12 / 85891 9 / 31511 5 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 18 / 73492 5 / 17831 5 / 386635 -- 18 / 73492 5 / 17831 5 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   6 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus 2 / 100203   14 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 14 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 42 / 262740   1 / 25954 -- 42 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 67 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 67 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 8 / 531904   -- -- 8 / 531904 0 / 212613