Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.23790Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 128 / 3259021 6 / 403641 412 / 25718729 8 / 491920 128 / 3259021 6 / 403641 412 / 25718729 8 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 4 / 38915 --   -- 4 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 5 / 103390 -- 2 / 100926 -- 5 / 103390 --
brain 9 / 261599   174 / 7554651 -- 9 / 261599 0 / 2128 174 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 2 / 233710 2 / 43127 1 / 56549 -- 2 / 233710 2 / 43127
cerebrum 3 / 228104 -- -- -- 3 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 30 / 718928 2 / 9837 19 / 2760977 -- 30 / 718928 2 / 9837 19 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 5 / 138066 -- 1 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 10 / 548222 -- 0 / 34979 -- 10 / 548222 --
heart   -- 7 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   11 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 11 / 1415985 --
limb   -- 8 / 595880 -- 0 / 16187 -- 8 / 595880 --
liver 2 / 104633   6 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 6 / 527425 --
lung 1 / 26861   6 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 6 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 3 / 216846 12 / 960632   2 / 85464 3 / 216846 12 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 2 / 354066 -- 5 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     37 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 37 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 2 / 145854 -- 1 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 8 / 636203 -- 6 / 82470 -- 8 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891   5 / 615945 4 / 57574 3 / 85891 0 / 31511 5 / 615945 4 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492 1 / 17831   -- 7 / 73492 1 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   1 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 1 / 100203     -- 1 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740   1 / 25954 -- 16 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 78 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 78 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 2 / 212613 -- -- 4 / 531904 2 / 212613